2月19日《自然》杂志精选
时间:2017-12-07

  2月19日,“自然”杂志精选 - 新闻 - 科学网

  美国国立卫生研究院Epigenomics Roadmap Consortium正在开展ENCODE项目,通过鉴定可直接从人类胚胎,成人,患病和健康组织获得的基因组中的功能性调控序列,编写人类原代细胞。并为主要组织提供全面的参考基因组。在本期“自然”杂志上,发表了八篇来自项目组的新论文,同时也设立了一个论坛,就“表意基因组路线图”项目的意义发表各种观点。目前的研究论文还附带有一个关于表观基因组路线图的在线文集(自然出版集团在各种出版物上发表的一系列研究论文)以及新闻报道和多媒体内容。

  锂在一个经典的明星形成

  尽管人们相信锂在宇宙中很早出现(其中一些也可能是宇宙大爆炸造成的),但今年晚些时候也有人怀疑,包括新的和超新星的爆炸。本文报道了在经典新星V339爆发后,铍-7(一种单一的电离放射性同位素铍衰变为锂-7,半衰期为53天)的高度蓝移的共振谱线。光谱。这一结果支持了理论预测,即在经典的星云爆炸中产生了大量的锂-7。

  自身免疫性疾病之间的遗传差异

  以前在全基因组关联研究(GWASs)中已经鉴定了数百个自身免疫风险位点,但是所涉及的位点包括连锁不平衡中的多个变体并且很少改变蛋白质编码序列,这使得它们的解释变得复杂。本研究采用新方法对21种自身免疫性疾病中的致病性遗传变异进行详细分析,将新算法应用于基于GWAS的位点,并将基因型数据与表观基因组进行比较以获得专门的免疫细胞图整合。结果表明,非常有针对性的增强子亚群参与T细胞的刺激,并作为自身免疫性疾病的致病决定因素。

  表观基因组图谱的单体型分辨率

  作为Epigenomics Roadmap项目的一部分,Bing Ren及其同事使用转染色体单体型重建策略构建了许多不同人体组织的单体型解决的表观基因组图谱。这些图显示染色质状态和转录中的等位基因偏差的广泛范围,并且这些偏差在组织和个体之间变化。作者还研究了基因与其控制序列之间的顺式调控关系以及重复序列的组织定义的活性。

  染色质在癌细胞中

  基因组研究表明,不同癌症类型的体细胞突变的局部密度和类型存在显着差异。这不仅由DNA序列的差异来解释,而且还由其他特征(包括表观遗传组织)来解释。 Shamil Sunyaev及其同事现在比较突变密度和不同细胞类型和组织的详细表观遗传特征。他们发现,癌症形成的特定细胞类型或组织的表观遗传特性是突变性状的决定因素,其比其他性状强得多。反过来,这些发现使得可以基于肿瘤的突变来推断关于其可能的组织来源的信息。

  阿尔茨海默氏症的免疫基础

  最近的全基因组关联研究显示,与非阿尔茨海默氏病相关的非编码区域存在显着的遗传变异,这表明涉及异常基因调控,然而,这些变异的功能到现在还不清楚,现在通过分析动力学Elizabeta Gjoneska及其同事发现,免疫反应基因及其调控区域是上调的,而突触弹性和学习记忆的调控区域是下调的,这些变化是高度保守的令人惊讶的是,与阿尔茨海默氏病有关的遗传变异体主要富集在免疫相关的高活性增强子中,并且在低活性的神经增强子中被耗尽。这表明对阿尔茨海默病的遗传易感性可能主要与免疫功能有关,而神经弹性可能主要受非遗传效应的影响。

  气候变化对沿海上涌的影响

  沿海上升提供了沿世界海洋东岸维持健康的海洋生态系统所需的营养物质。历史记录分析表明,洋流中的一些上升流已经得到加强,但到目前为止尚未就预测上涌对气候变暖的未来变化的影响分析由Daiwei Wang及其同事对CMIP5模型档案(一系列广泛的,协调一致的气候模式实验)进行的22次模拟分析发现,到21世纪末,沿海上涌季节大西洋和太平洋东部边界将开始年长的,晚些时候结束的时候,高纬度地区会变得更加强大,从而变得更加统一,这些变化可能会影响海洋生物多样性的地理分布。

  (田学文/编译更多信息,请访问www.naturechina.com/st)

  “中国科学”(2015-03-02第二版国际)